建議在規劃的實施過程中，需要選擇七大戰略性新興產業的若干重要領域，對產業鏈、價值鏈和創新鏈進行系統分析，按照全球產業分工和價值分享框架，編制這些行業產業生態系統建設的實施方案，對技術創新，有競爭力的制造，專有基礎設施和服務體系建設，消費市場啟動，投資與風險分擔機制等進行統籌安排和合理部署，并將工作任務分解到各個部門。同時，要在這樣的一個框架下對規劃實施情況、創新績效、產業發展績效、政策激勵績效等進行年度的跟蹤評估，并根據跟蹤評估的結果，結合國內外產業發展的新趨勢和特點，及時調整規劃實施方案。
　　在實施中突出信息、可再生能源和生物三大重點領域
　　戰略性新興產業發展的“十二五”規劃的部署全面而系統，但這種全面性，也帶來了產業發展邊界過寬、難以優化資源配置和相關支持措施。課題組建議在規劃的實施過程中，科學判斷全球戰略性新興產業的發展趨勢，根據我國現有的產業基礎和比較優勢，進一步突出重點。從目前全球新興產業發展的趨勢來看，新一代的電子信息和可再生能源產業的融合發展，帶來社會能源生產方式和消費方式的改變，并導致其他產業組織方式的變革，最終將可能引發第三次工業革命;轉基因育種、干細胞治療等生物技術已經取得突破性進展，生物工程和新醫藥產業將會成為未來的支柱和主導產業。從歐、美和日本等發達國家，韓國等新興工業化國家，以及印度、巴西等發展中大國的發展戰略和投資重點來看，其重點也集中在新一代信息技術、新能源和生物產業。因此，課題組建議規劃的實施過程中，聚焦上述三大重點產業領域，集中優勢資源，著力突破。
建立多元化、多層次投資與風險分擔機制
　　戰略性新興產業大多處在發展的初期，其技術路線和主流產品都還沒有形成，不同技術路線的全球競爭，給投資者帶來巨大贏利空間的同時，也給他們帶來了巨大的風險。正是由于對風險規避的考慮，我國大多數投資人和企業會選擇在產業發展的快速增長期和成熟期再進入，如太陽能和風能發電，新能源汽車。這樣做的好處在于有利于規避風險，并贏得較為穩定的收益;壞處在于一定會形成技術和產業發展的路徑依賴。
　　要想鼓勵投資人和企業在產業發展初期更早進入技術和產業發展的競爭，需要建立政府、風險投資公司、保險公司、生產銷售企業等多元化的投資與風險分擔機制。這種投資與風險分擔機制重點包括政府對高風險的前沿技術開發與應用的持續投入機制，政府對多種技術路線的創新活動的持續投入，保險公司對新產品和新裝備試用的風險擔保機制等。通過這種多元化、多層次投資與風險分擔機制，引導社會資源向產業技術創新前沿積聚，結合重大創新發展工程和應用示范工程，盡快在自主創新的基礎上構建具有全球競爭力的技術體系和產業體系。